MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO2

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021986	G	6	6	1	6	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021986	CGC	2	6	24	29	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021986	ACGG	2	8	54	61	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021986	CGC	2	6	101	106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021986	CG	3	6	119	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021986	GTC	2	6	151	156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021986	C	6	6	175	180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_021986	C	6	6	190	195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_021986	CCGG	2	8	197	204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021986	CGGC	2	8	215	222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021986	C	6	6	250	255	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_021986	GCC	2	6	256	261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021986	C	8	8	284	291	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_021986	CCACC	2	10	299	308	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
15	NC_021986	CGG	2	6	332	337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021986	AC	3	6	349	354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021986	GCCTG	2	10	391	400	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021986	CGC	2	6	409	414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_021986	GGC	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021986	GCC	2	6	666	671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021986	GAC	2	6	746	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021986	GCC	2	6	958	963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_021986	GGGA	2	8	1075	1082	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021986	GT	3	6	1091	1096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021986	CCT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021986	TCAC	2	8	3835	3842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021986	GAC	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021986	GCA	3	9	4248	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021986	CA	3	6	4255	4260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021986	GC	3	6	4307	4312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021986	TG	3	6	4916	4921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021986	G	6	6	4946	4951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021986	C	6	6	5413	5418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_021986	GCC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021986	TCG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021986	CCGGT	2	10	5547	5556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_021986	G	6	6	5564	5569	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021986	ACGG	2	8	5593	5600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021986	AC	3	6	5611	5616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021986	CGG	2	6	5689	5694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021986	GTC	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021986	GTC	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021986	C	6	6	6445	6450	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_021986	CCGAC	2	10	6487	6496	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_021986	CCGG	2	8	6534	6541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021986	CG	3	6	6590	6595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021986	CCCA	2	8	6648	6655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_021986	AGC	3	9	6679	6687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021986	GAC	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021986	CCG	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021986	GCC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_021986	CAG	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021986	ACG	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021986	CCG	2	6	7998	8003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021986	CGT	3	9	8052	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021986	GGCC	2	8	8128	8135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021986	TCG	4	12	8756	8767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021986	CAT	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021986	CCGG	2	8	8797	8804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021986	GCC	2	6	8812	8817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021986	CAT	2	6	8835	8840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021986	CCG	2	6	8846	8851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021986	GCC	2	6	8925	8930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021986	CAT	2	6	8959	8964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021986	GAC	2	6	9876	9881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021986	GTC	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021986	GAC	2	6	10215	10220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021986	CCG	2	6	10222	10227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021986	CCG	2	6	10238	10243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_021986	GTGG	2	8	10255	10262	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021986	GC	3	6	10275	10280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021986	GA	3	6	10385	10390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021986	CCA	2	6	10728	10733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_021986	TG	3	6	13304	13309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021986	CGT	2	6	13322	13327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021986	TGC	2	6	13428	13433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021986	GTC	2	6	13475	13480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021986	GAC	2	6	13486	13491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021986	CGT	2	6	13537	13542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021986	GTTTCT	2	12	15662	15673	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021986	GGA	2	6	15683	15688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021986	G	7	7	15695	15701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021986	CGT	2	6	16441	16446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021986	CCA	2	6	16483	16488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021986	TGG	2	6	16524	16529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021986	CGACGC	2	12	16564	16575	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021986	CCG	2	6	16578	16583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021986	GTG	2	6	16856	16861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021986	CG	3	6	16900	16905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021986	CG	3	6	16961	16966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021986	GCA	2	6	17002	17007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021986	CG	3	6	17035	17040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021986	CAC	2	6	17044	17049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_021986	GGC	2	6	17050	17055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021986	AAC	2	6	17062	17067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021986	GCC	2	6	17088	17093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021986	CGA	2	6	17119	17124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021986	GCC	2	6	17128	17133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_021986	C	7	7	17141	17147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_021986	GCG	2	6	17151	17156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021986	AG	3	6	17228	17233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021986	GCA	2	6	18764	18769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021986	CGG	2	6	18827	18832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021986	GCC	2	6	18847	18852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_021986	GGC	2	6	18922	18927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021986	G	6	6	18929	18934	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021986	CGGC	2	8	18958	18965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021986	C	7	7	18977	18983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_021986	GCC	2	6	18985	18990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021986	C	6	6	18997	19002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_021986	G	6	6	19016	19021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021986	AG	3	6	19046	19051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021986	AC	3	6	19112	19117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021986	CAC	2	6	19174	19179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021986	CCAC	2	8	19198	19205	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_021986	CA	3	6	19206	19211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021986	CCG	2	6	19230	19235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021986	CGG	2	6	19253	19258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021986	C	6	6	19309	19314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.